Født i Vilnius, Litauen, begynte Giedrė Šlekytė sin musikkutdannelse ved den nasjonale M. K. Čiurlionis kunstskole i Vilnius. Hun fortsatte deretter sine dirigentstudier ved Universität für Musik und darstellende Kunst i Graz, Hochschule für Musik und Theater i Leipzig og Zürcher Hochschule der Künste.
Giedrė Šlekytė er internasjonalt ettertraktet som gjestedirigent og har allerede arbeidet med Staatskapelle Berlin, Münchner Philharmoniker, Wiener Symphoniker, hr-Sinfonieorchester Frankfurt, Boulez Ensemble Berlin, Sveriges Radios Symfoniorkester, Camerata Salzburg, Sächsische Staatskapelle Dresden, Konzerthausorchester Berlin, SWR Symphonieorchester, Orchestre de chambre de Paris, Litauens nasjonale symfoniorkester, Orquestra Simfònica de Barcelona og Nederlands Filharmonisk Orkester.
Etter sin stilling som 1. kapellmester ved Stadttheater Klagenfurt fra 2016 til 2018, dirigerte Giedrė Šlekytė nye operaproduksjoner ved Oper Frankfurt (Dialogues des Carmélites), Komische Oper Berlin (Káťa Kabanová), Den Kongelige Danske Opera (Ariadne auf Naxos), Bayerische Staatsoper (L’infedeltà delusa), MusikTheater an der Wien (The Cunning Little Vixen) og Opera Ballet Vlaanderen (Rusalka, Werther), i tillegg til gjenopptakelser ved Staatsoper Berlin, Semperoper Dresden, Bayerische Staatsoper, Opernhaus Zürich, Hamburgische Staatsoper, Tokyo Nikikai Opera Foundation, Oper Frankfurt, Deutsche Oper Berlin og Litauens nasjonale opera.
I sesongen 2024/25 debuterer hun ved Wiener Staatsoper (La Bohème) og Royal Opera House i London (Hansel og Gretel), og returnerer til Staatsoper Berlin (Les pêcheurs de perles, Le Sacre du printemps) og MusikTheater an der Wien (ny produksjon av Das Paradies und die Peri).
Denne sesongen har hun også symfoniske oppdrag med blant andre Münchner Philharmoniker, Philharmonia Orchestra i London, NHK Symphony Orchestra i Tokyo, Dallas Symphony Orchestra, Rundfunk-Sinfonieorchester Berlin, Litauens statlige symfoniorkester, SWR Symphonieorchester og Bruckner Orchester Linz, hvor hun har vært hovedgjestedirigent siden 2021.
Høsten 2019 utga Deutsche Grammophon portrett-CD-en Raminta Šerkšnytė, hvor Giedrė Šlekytė dirigerer oratoriet Songs of Sunset and Dawn med Litauens nasjonale symfoniorkester.
Giedrė Šlekytė er prisvinner av «International Malko Competition for Young Conductors» i København. I 2015 ble hun nominert til Salzburg-festivalens Young Conductors Award, og i 2018 ble hun nominert som «Årets nykommer» ved International Opera Awards.
